San José Miahuatlán, Coxcatlán, Santiago Miahuatlán y Ajalpan son los municipios de la región Tehuacán-Ajalpan donde se registraron inconformidades previo al conteo de las actas electorales, con las cuales se determina quién resultó ganador de la elección del pasado primero de julio.

En San José Miahuatlán se denunció ante el Consejo Municipal del Instituto Estatal Electoral (IEE) que hubo varias inconsistencias durante el conteo en las diferentes casillas, así como compra de votos en la jornada electoral, por lo que no podían hacer válida la victoria de Héctor Gutiérrez Morales, candidato del Partido Revolucionario Institucional (PRI), quien obtuvo el 40.73 por ciento de la votación, de acuerdo con el PREP.

En Coxcatlán el ganador fue Aldo Rogelio Arvizu Robles, con un porcentaje de acuerdo con el PREP de 19.50 por ciento. Él representa a Morena, mientras que Irma Martínez Vargas, del PRI, tuvo el 17.88 por ciento, ahí la inconformidad fue que los seguidores de ésta alegaban un recuento total para garantizar que no se les hiciera fraude.

En Santiago Miahuatlán hubo un malentendido, se les dijo a los militantes de Morena que se contarían los votos de cuatro casillas donde hubo disturbios, con los que no estuvieron de acuerdo, aunque en realidad eso no fue así; el acuerdo de los representantes de partido fue anular las cuatro casillas, pero no se les dijo a tiempo a los militantes y por eso se molestaron.

Para el caso de Ajalpan la elección fue cerrada entre Ignacio Salvador Hernández, de Por Puebla al Frente, y Rafael Trujillo, de Morena, eso provocó que ambos grupos se apostaran en las afueras del Consejo Municipal del IEE a la espera, unos de confirmar la victoria, y otros de revertir el resultado.